生物化学课件.ppt
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1、欢迎各位老师到南京大学!欢迎各位老师到南京大学!热点问题热点问题第二十一种标准氨基酸和第二十二种标准氨基酸核酶与RNA世界DNA复制的忠实性人类基因组“末端的烦恼”焦磷酸测序第二十一种标准氨基酸含硒半胱氨酸与北大富硒康发现于1986年实例:谷胱甘肽过氧化物酶;去碘酶密码子UGA 第二十二种标准氨基酸吡咯赖氨酸 发现于2002年存在于一些真细菌和古细菌体内,作为与产甲烷代谢有关的某些酶的组分 密码子为UAG RNA与DNA结构之别结构之别功能之别功能之别RNARNA世界及其主要证据世界及其主要证据 (1 1)RNARNA既作为遗传物质又作为核酶既作为遗传物质又作为核酶 (2 2)逆转录酶)逆转录
2、酶 (3 3)先有核糖核苷酸后有脱氧核苷酸)先有核糖核苷酸后有脱氧核苷酸 (4)核开关的发现RNA,RNA,RNARNA,RNA,RNA,RNARNA,RNA,RNARNA, RNA,RNARNA 世界世界DNA蛋白质蛋白质DNA复制的高度忠实性-10-1010-11四种dNTPs浓度的平衡 DNA聚合酶的高度选择性 -选择核苷酸的机制有点像“盲人厨师”对调味品的选择。 DNA聚合酶的自我校对 错配修复 使用RNA作为引物 绝绝 句句南京大学南京大学 生化系生化系 杨荣武杨荣武复错不要紧,只要校对真,错了我一个,还有后来酶。烦恼的解除烦恼的解除使用端聚酶;经重组形成串联体;将线形DNA暂时转变
3、为环形DNA;滚环复制;使用蛋白质-dNTP作为引物。 焦磷酸测序焦磷酸测序 原理 焦磷酸测序是在同一反应体系中由4种酶催化的的酶级联化学发光反应,在每一轮测序反应中,只加入一种dNTP,若该dNTP与模板配对,聚合酶就可以将其掺入到引物链的3-端并释放出等量的焦磷酸基团(PPi)。PPi可转化为可见光信号,并最终转化为一个峰值。每个峰值的高度与反应中掺入的核苷酸数目成正比。然后加入下一种dNTP,继续下一轮DNA链的合成。 步骤(1)1个特异性的测序引物和单链DNA模板结合,然后加入四种酶的混合物,包括:DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和双磷酸酶。反应底物有腺苷-5-磷酸硫酸(APS)
4、和荧光素。(2)向反应体系中加入1种dNTP,如果它正好能和DNA模板的下一个碱基配对,则会在DNA 聚合酶的作用下,添加到测序引物的3-端,同时释放出1分子的PPi。dATP由腺苷-硫-三磷酸,dATPS)替代,因为DNA聚合酶对dATPS的催化效率比对dATP的催化效率高,且dATPS不是荧光素酶的底物。(3)在ATP硫酸化酶的作用下,生成的PPi可以和APS结合形成ATP;在荧光素酶的催化下,生成的ATP又可以和荧光素结合形成氧化荧光素,同时产生可见光。通过电荷耦合器光学系统即可获得一个特异的检测峰,峰值的高低则和相匹配的碱基数成正比。(4)反应体系中剩余的dNTP和残留的少量ATP在双
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